Микробиологични и генетични проучвания върху клинични изолати Streptococcus pyogenes

Кратка информация за статията
dc.contributor.authorМухтарова, Адиле Акифова // Muhtarova, Adyle Akifova
dc.date.accessioned2019-07-02T13:27:38Z
dc.date.available2019-07-02T13:27:38Z
dc.date.issued2019-07-02
dc.descriptionдисертационен труд за присъждане на научна и образователна степен „доктор”; 4. Природни науки, математика и информатика; Професионално направление 4.3. Биологически науки; Докторска програма: МИКРОБИОЛОГИЯ; Научен ръководител: доц. д-р Райна Цветанова Гергова, дм; София 2018 г.en_US
dc.description.abstractЦeл и задачи Цел на настоящия дисертационен труд е: Да се оптимизира диагностичния алгоритъм за бърза етиологична диагноза на инфекциите, причинени от S. pyogenes, да се проучат факторите на вирулентността и резистентността към важни групи антимикробни средства на клинично значими изолати S. pyogenes и да се извърши епидемиологично типизиране на циркулиращите S. рyogenes. За осъществяване на тази цел си поставихме следните задачи: 1) Да се създаде колекция от замразени S. pyogenes и от екстракти на техните геномни ДНК, от клинично-значими щамове, изолирани от български пациенти с различни стрептококови инфекции. 2) Да се разработят молекулярно-генетични методи (PCR, RT-PCR) за бърза етиологична диагноза на инфекции, причинени от S. рyogenes. 3) Да се проучи антибиотичната чувствителност към основни за терапия групи антимикробни средства: пеницилини, макролиди, линкозамиди, тетрациклини. Да се определят механизмите на макролидната и тетрациклинова резистентност. 4) Да се направят препоръки за емпирична терапия на инфекциите причинени от S. рyogenes, в зависимост от установените данни за резистентност в нашата страна. 5) Да се проучат важни фактори на вирулентността от групите на токсините, ензимите и суперантигените. 6) Да се типизират колекционираните изолати чрез определяне на emm-генотиповете и съответните им MLST типове, както и анализиране на връзката между установените клонове, гените на резистентност и клиничната диагноза. // Summary. During the period of five years (2013-2017) we have investigated the incidence and the etiological role of Streptococcus pyogenes in patients from different age groups with infections exposing various clinical manifestations. Two new molecular-genetic methods for fast direct detection of streptococcal etiology in the samples from patients were developed. A total 445 non-duplicate clinical strains S. pyogenes isolated from patients with invasive and noninvasive infections were studied to evaluate the distribution of genetic elements, encoding 21 virulence factors and resistance to macrolides and tetracyclines, and to establish the circulation of different emm and sequence types (ST) in Bulgarian streptococcal isolates. All tested strains were showed that the presence of speB, spyCep, sdaB, slо and speA, speF, speL, speM (p<0.001) were significantly more common in invasive isolates. During the 5-year study period, the frequency of macrolide resistance in S. pyogenes was over 30%. The macrolide-resistance genotypes distribution was as follows: mef(A) at 51.1% alone and 22% in combination with erm(B)/or erm(A), erm(B) at 11.4% alone and 20% in combination with mef(A), and resp. erm(A) at 9.3% and 2% in combination with mef(A). A total of 10.3% were tetracycline resistant and harbored ribosomal protection genes: tet(M) at 85%, tet(O) resp. 15%. After the emm-genotyping by PCR and following sequencing 15 different emm types including 27 sub-types were identified. Two new subtypes for the world emm3.132 and emm3.133 were established (GenBank NCBI MG869722 and MG869723). The most prevalent emm types were emm1 (24.7%), emm3 (19.2%), emm12(11%) and emm4 (11%). The emm types identified belong to 8 emm-clusters: A-C3, E4, A-C5, A-C4, E1, E6, M6, E3, cladeY. Cluster A-C3 was statistically significant associated with the genes for super-antigenes SpeA, speG, speJ, while cluster E4 with speC. The rheumatogenic emm types were comprised 49.9% and resp. 67 the nephritogenic ones 46.7% of characterized isolates. The predominant (87.5%) of erm(B) + strains were belonged to emm28. We were established by MLST 8 sequence types (ST28, ST15, ST39, ST36, ST52, ST63, ST382, ST847) in the studied S. pyogenes isolates. The new proposed 26-valent and 30-valent anti-GAS vaccines can protect against 84.4% and resp. 100% of emm types that were detected in our survey.en_US
dc.description.sponsorshipУчастия в проекти 1. Договор №7/2015 на МУ-София, СМН: Клинични, микробиологични и генетични проучвания върху един от най-значимите причинители на респираторни инфекции в детска възраст Streptococcus pyogenes Участник в екипа. 2. Договор 2-Д/2016 на МУ-София, СМН: Алгоритъм за установяване на новопоявила се резистентност към макролиди при Streptococcus pyogenes в български клинични изолати Водещ изследовател. 3. Договор №3-С/2016 на МУ-София, СМН: Молекулярно-генетичен анализ на вирулентността, резистентността и епидемиологията на български клинично значими изолати Streptococcus pyogenes Участник в екипа. 4. Договор №Д-139/2017 на МУ-София, СМН: Епидемиологично типиране на щамове Streptococcus pyogenes, изолирани от болни с различни инфекции Водещ изследовател. 5. Договор №Д-56/2017 на МУ-София, СМН: Проучване токсигенността и макролидната резистентност при клинично значими пиогенни коки Streptococcus pyogenes и Staphylococcus aureus Участник в екипа. 6. Договор №Д-59/2018 на МУ-София, СМН: Микробиологично и генетични проучвания върху антибиотичната резистентност при Streptococcus pyogenes и други бета-хемолитични стрептококи Участник в екипа.en_US
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/10861/1645
dc.language.isootheren_US
dc.subjectSTREPTOCOCCUS PYOGENES инфекции - диагностика; вирулентност, антибиотична резистентност, генетично типизиране // en_US
dc.subjectSTREPTOCOCCUS PYOGENES infections - diagnosis; virulence, antibiotic resistance; genetic typingen_US
dc.titleМикробиологични и генетични проучвания върху клинични изолати Streptococcus pyogenesen_US
dc.typeThesisen_US
Файлове
Original bundle
Показани 1 - 2 от 2
thumbnail.default.alt
Име:
Adile_Muhtarova-dis.pdf
Размер:
5.23 MB
Формат:
Adobe Portable Document Format
Описание:
Dissertation
Изтегли
thumbnail.default.alt
Име:
Adile_Muhtarova-ref.pdf
Размер:
1.64 MB
Формат:
Adobe Portable Document Format
Описание:
Abstract
Изтегли
License bundle
Показани 1 - 1 от 1
thumbnail.default.alt
Име:
license.txt
Размер:
1.71 KB
Формат:
Item-specific license agreed upon to submission
Описание:
Изтегли
Колекции
Дисертации / Dissertations